Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms