Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP99D6REC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms