Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms