Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERVV-1B6SEH8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERVV-1B6SEH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms