Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF839A8K0R7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF839A8K0R7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF839A8K0R7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms