Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD3A6NKT7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD3A6NKT7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD3A6NKT7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms