Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCNX2A6NKB5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNX2A6NKB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNX2A6NKB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms