Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF233A6NK53 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF233A6NK53 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF233A6NK53 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms