Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZNF316A6NFI3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF316A6NFI3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms