Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A0D9SFI3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
A0A0D9SFI3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms