Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms