Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4E1Q9UPM8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms