Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PALD1Q9ULE6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PALD1Q9ULE6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms