Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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COPS7AQ9UBW8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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