Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms