Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPOQ9BU64 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPOQ9BU64 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms