Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms