Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLRP3Q96P20 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms