Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms