Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX27Q96L92 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms