Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLDN23Q96B33 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN23Q96B33 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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