Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PHIPQ8WWQ0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHIPQ8WWQ0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms