Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBOF1Q8ND07 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms