Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SVOPQ8N4V2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SVOPQ8N4V2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms