Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms