Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENND5BQ6ZUT9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms