Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHD9Q3L8U1 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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