Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HIST3H3Q16695 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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