Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NTRK2Q16620 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms