Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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