Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms