Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDCD1Q15116 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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