Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms