Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ITGA9Q13797 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA9Q13797 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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