Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOFQ13790 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOFQ13790 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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APOFQ13790 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
APOFQ13790 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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