Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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