Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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