Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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