Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TROQ12816 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TROQ12816 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TROQ12816 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TROQ12816 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TROQ12816 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TROQ12816 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TROQ12816 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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