Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CALD1Q05682 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms