Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms