Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBE1Q04446 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms