Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms