Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ID3Q02535 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ID3Q02535 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ID3Q02535 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ID3Q02535 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ID3Q02535 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ID3Q02535 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
ID3Q02535 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms