Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN7AQ01118 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms