Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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