Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FAM3BP58499 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms