Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNA2D1P54289 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms