Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP3P50461 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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