Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCAMP43121 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCAMP43121 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms